Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms