Protein–RNA interactions for Protein: A6NLX3

SPDYE4, Speedy protein E4, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE4A6NLX3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPDYE4A6NLX3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms