Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM200CA6NKL6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM200CA6NKL6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM200CA6NKL6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM200CA6NKL6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM200CA6NKL6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM200CA6NKL6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM200CA6NKL6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM200CA6NKL6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM200CA6NKL6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM200CA6NKL6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM200CA6NKL6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM200CA6NKL6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM200CA6NKL6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM200CA6NKL6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM200CA6NKL6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM200CA6NKL6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM200CA6NKL6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM200CA6NKL6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM200CA6NKL6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM200CA6NKL6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM200CA6NKL6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM200CA6NKL6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM200CA6NKL6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM200CA6NKL6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM200CA6NKL6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM200CA6NKL6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM200CA6NKL6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM200CA6NKL6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms