Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PSDA5PKW4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms