Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCHNA4D1U4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms