Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ERCC1-204ENST00000423698 3119 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 TMCC2-203ENST00000358024 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 GNAT1-201ENST00000232461 2417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 DCLK2-202ENST00000302176 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CEP83-203ENST00000397809 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CDH5-208ENST00000614547 3779 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SUPT5H-203ENST00000402194 3698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ERBB2-219ENST00000584601 4792 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 STRADA-201ENST00000245865 2959 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CD5-201ENST00000347785 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 MGLL-205ENST00000453507 4552 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ITGAX-204ENST00000562918 1521 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 PAX6-243ENST00000638903 2620 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 NUPL2-201ENST00000258742 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ZHX1-206ENST00000522655 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC022167.2-201ENST00000565934 2288 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AF067845.2-201ENST00000617093 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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LSAMPQ13449 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 NMUR2-201ENST00000255262 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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LSAMPQ13449 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 RPH3A-202ENST00000415485 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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LSAMPQ13449 RGL4-201ENST00000290691 2885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 TP53-218ENST00000610292 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CDC37L1-201ENST00000381854 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 LHFPL5-201ENST00000360215 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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LSAMPQ13449 MAGED2-204ENST00000375058 2048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 LRIT2-201ENST00000372113 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 SLC37A1-202ENST00000398341 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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LSAMPQ13449 CNOT3-202ENST00000358389 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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LSAMPQ13449 TACC2-201ENST00000260733 3644 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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LSAMPQ13449 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 KRT38-201ENST00000246646 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC107892.1-201ENST00000577382 2727 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 BOLA2-SMG1P6-201ENST00000565417 3103 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ARL3-201ENST00000260746 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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