Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AKR1C6P-201ENST00000432950 983 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms