Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 TACC1-208ENST00000520340 1976 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 RNF4-216ENST00000511859 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 SPINK2-201ENST00000248701 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 ZNF816-201ENST00000270457 582 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 TBC1D3P3-201ENST00000342824 1080 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 LINC00618-201ENST00000435624 700 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 RN7SL105P-201ENST00000475661 299 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 SLC25A5P6-201ENST00000515328 886 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 RRNAD1-211ENST00000524343 459 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC023078.3-201ENST00000527463 958 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 KRT127P-201ENST00000547183 433 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 MPI-212ENST00000565576 1148 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 PDLIM1P1-201ENST00000604187 969 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC091905.3-201ENST00000624959 234 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AGFG1-203ENST00000409171 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC067852.6-201ENST00000591237 1736 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 ACAA2-205ENST00000587994 1657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 FAM156A-203ENST00000611661 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 LMO7DN-201ENST00000318245 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 RNF170-202ENST00000319073 1265 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 RIPPLY2-201ENST00000369687 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 MRPL23-203ENST00000397294 551 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC253536.1-201ENST00000437021 315 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 PIEZO1P1-201ENST00000485427 219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 RN7SL304P-201ENST00000488028 301 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC096713.1-201ENST00000514650 978 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 EXTL3-AS1-204ENST00000523789 543 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC108002.3-201ENST00000612629 503 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AKTIP-201ENST00000300245 2133 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 PMP22-203ENST00000395938 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 CREB5-204ENST00000396300 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 PRKCE-202ENST00000394874 996 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 FAM45BP-201ENST00000408950 1074 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC118758.1-201ENST00000448242 564 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 FAM153C-208ENST00000511189 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AP001979.1-201ENST00000529222 751 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AP001922.6-201ENST00000532553 546 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 EEF1DP8-201ENST00000534760 536 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 FP671120.4-201ENST00000629969 923 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 CCRL2-202ENST00000399036 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 RORC-201ENST00000318247 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AOX3P-202ENST00000469595 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 LINC02465-203ENST00000513875 1777 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 RHBDL2-201ENST00000289248 2129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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