Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AD000091.1-201ENST00000592379 287 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 PDE9A-211ENST00000398232 1885 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 OMA1-201ENST00000371226 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ZNF669-204ENST00000448299 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 CAMK2B-202ENST00000346990 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ZKSCAN5-202ENST00000394170 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 MIS18BP1-201ENST00000310806 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 TREM2-201ENST00000338469 860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC026461.4-201ENST00000379816 242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 GAGE12H-201ENST00000381722 527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AL162386.1-201ENST00000433817 645 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 YBX1P7-201ENST00000436766 535 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ARL17B-202ENST00000450673 743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ARL15-205ENST00000507646 578 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC018620.1-201ENST00000523233 379 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 CLNS1A-202ENST00000525064 1121 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC078776.1-201ENST00000546558 562 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 CHORDC2P-201ENST00000557601 1090 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ACAP1-204ENST00000570504 274 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC005154.1-227ENST00000579174 755 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC010271.2-201ENST00000614440 588 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 PEX1-204ENST00000438045 3329 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 FOLR1-201ENST00000312293 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 DBI-202ENST00000355857 637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AL391987.4-201ENST00000377547 439 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 PPM1N-204ENST00000401593 548 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC074351.1-201ENST00000439413 481 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AKIRIN1P2-201ENST00000440655 570 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 CDCA4P3-201ENST00000442572 689 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 NDUFC1-206ENST00000505036 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AL133372.2-202ENST00000549360 768 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC012615.6-203ENST00000590531 272 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 Metazoa_SRP.76-201ENST00000619429 290 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 TNNT3-216ENST00000641119 941 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 LUC7L-203ENST00000397780 1335 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ERGIC3-202ENST00000348547 1359 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRXP46100 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ZNF101-203ENST00000415784 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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