Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 DNM1L-220ENST00000549701 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 SCRN1-207ENST00000434476 1454 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 FRG2EP-201ENST00000634243 835 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AL449403.1-201ENST00000432783 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC27P30260 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 MIR22HG-208ENST00000574306 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 LINC02465-203ENST00000513875 1777 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 PYGL-206ENST00000544180 2696 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 MAGEA11-202ENST00000355220 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 MT1F-201ENST00000334350 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC27P30260 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC27P30260 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC27P30260 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC27P30260 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms