Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 ART2P-201ENST00000415521 822 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 PYY3-201ENST00000419078 213 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AL606970.2-201ENST00000434596 470 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 CNTFR-AS1-201ENST00000436360 892 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ALG1L10P-201ENST00000437882 424 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 TMX3-202ENST00000443099 913 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 CNTFR-AS1-203ENST00000453642 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AL162464.2-201ENST00000557761 526 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 RN7SL784P-201ENST00000577319 342 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 SNORD55-201ENST00000581525 80 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC092611.3-201ENST00000624858 718 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 NIFK-AS1-202ENST00000414554 1411 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 OR4C5-201ENST00000319813 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 THYN1-202ENST00000352327 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 SNORA52-201ENST00000362915 134 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AL358876.2-201ENST00000424689 477 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 RBMS3-207ENST00000445033 1120 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC007255.1-202ENST00000447171 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 DMKN-244ENST00000480502 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 NUP210P2-201ENST00000510577 282 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 LINC02105-202ENST00000511953 870 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC009901.2-201ENST00000521595 240 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AP003717.2-201ENST00000534962 898 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 COPZ1-206ENST00000549043 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC005580.1-201ENST00000592311 583 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC018755.1-201ENST00000601315 1182 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC132216.1-201ENST00000610375 1158 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 SERPING1-213ENST00000619430 634 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 TUBD1-203ENST00000346141 1490 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ELOC-205ENST00000520210 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 TCEAL9-201ENST00000372656 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AL096677.1-201ENST00000442884 814 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC106748.1-201ENST00000454801 384 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 MGC32805-201ENST00000503529 579 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC091965.1-201ENST00000512406 440 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC008514.1-203ENST00000518172 574 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 TMEM253-206ENST00000556585 1236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC008870.3-201ENST00000566143 641 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC100830.3-201ENST00000583044 554 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 MAP3K14-AS1-207ENST00000588698 460 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC079779.3-227ENST00000591927 860 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 RN7SL341P-201ENST00000613745 298 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 HIST1H2APS4-202ENST00000635537 681 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 FAM9A-201ENST00000381003 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 IDH3A-207ENST00000558554 1595 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC015959.1-201ENST00000623263 1377 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AL031575.1-201ENST00000416609 845 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AL356488.1-201ENST00000429752 609 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 C21orf62-203ENST00000487113 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC093871.1-201ENST00000503815 534 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC090376.1-202ENST00000587276 470 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms