Protein–RNA interactions for Protein: P33778

HIST1H2BB, Histone H2B type 1-B, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H2BBP33778 PROSER2-AS1-201ENST00000445498 3146 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 CCDC175-202ENST00000537690 2616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 CNGB1-204ENST00000564448 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 NSD3-202ENST00000317025 10776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 EIF4E3-205ENST00000448225 6209 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 KRT40-201ENST00000377755 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 RCHY1-201ENST00000324439 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 PTCH1-209ENST00000437951 8049 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 TMCO4-201ENST00000294543 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 NRAP-201ENST00000359988 5580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 PLEKHA7-211ENST00000531066 4561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 PAX4-208ENST00000639438 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 PLOD1-201ENST00000196061 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 OR4X1-201ENST00000320048 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 AC022424.2-201ENST00000514848 454 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 TRMT112P6-201ENST00000599234 372 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 AC003991.1-211ENST00000631117 870 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 LOXHD1-210ENST00000536736 6848 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 IFNAR2-205ENST00000404220 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 AL365259.1-204ENST00000606001 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 WASL-201ENST00000223023 4435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 LONRF2-202ENST00000409647 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 FUT6-201ENST00000286955 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 APOBEC3C-201ENST00000361441 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 RAB29-202ENST00000367139 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 FAM81A-201ENST00000288228 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 POMGNT1-203ENST00000396420 3480 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 UQCC1-203ENST00000374380 2133 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 CCDC149-202ENST00000389609 2127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 KBTBD12-201ENST00000343941 4121 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 SEC23B-204ENST00000377475 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 ZWINT-204ENST00000395405 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 MYO10-210ENST00000513610 8038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 NPY2R-201ENST00000329476 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 TSPAN2-202ENST00000369516 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 ZZEF1-201ENST00000381638 11456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 AC004490.1-201ENST00000585593 2738 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 DPY19L2P1-202ENST00000454445 2909 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 FAM153B-211ENST00000510151 1641 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 FAM153A-216ENST00000510276 1641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 FER1L5-206ENST00000624922 6367 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 DIS3L2-204ENST00000409307 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 SCLT1-201ENST00000281142 3055 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 SLC25A25-201ENST00000373064 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 THEMIS3P-201ENST00000416112 1586 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 NADK-204ENST00000378625 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 ADGRG1-266ENST00000568908 3852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 ITSN1-201ENST00000379960 3026 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 AC136604.2-201ENST00000500262 1966 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 CAPN9-203ENST00000366666 2173 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 PRIMA1-203ENST00000393143 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 ANXA11-202ENST00000372231 6720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 OPRM1-204ENST00000360422 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 STAG3L4-202ENST00000416602 2143 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 TLE3-213ENST00000558379 2304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 ELMSAN1-204ENST00000423556 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 ACVR1-203ENST00000410057 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 VPS39-201ENST00000318006 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIST1H2BBP33778 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms