Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 GMNN-207ENST00000620958 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AL354704.1-201ENST00000629369 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 TACC1-209ENST00000520611 1550 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 UGT1A1-201ENST00000305208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 FAM95B1-211ENST00000592053 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AL669942.1-203ENST00000610972 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 TOP1MT-213ENST00000521193 1960 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AP000229.1-201ENST00000608591 1979 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 OR10K2-201ENST00000314902 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 TCTE1-201ENST00000371504 616 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 HMBS-202ENST00000392841 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 KRT41P-201ENST00000393988 1293 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC064836.1-201ENST00000405197 704 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 GALM-202ENST00000410063 1023 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 P2RX6P-202ENST00000450626 357 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 SNHG14-207ENST00000452731 1064 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 LAMTOR5-203ENST00000474861 1154 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 MOG-229ENST00000483013 279 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 MOG-232ENST00000490427 327 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 CLNS1A-202ENST00000525064 1121 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 CBX3P4-202ENST00000540428 423 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AL121790.2-201ENST00000553425 379 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AL139022.1-202ENST00000553633 796 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 SH3GL1P2-201ENST00000582245 1082 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC034238.1-214ENST00000609699 1590 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AL592295.4-201ENST00000636161 997 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 ZDHHC4-202ENST00000396706 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 NNMT-201ENST00000299964 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 IST1-221ENST00000544564 1500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 IMMP1L-201ENST00000278200 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 KRTAP12-4-201ENST00000391618 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC002451.1-202ENST00000432265 771 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 PARVG-208ENST00000466375 820 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 RN7SL229P-201ENST00000495651 299 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 KRT19P3-201ENST00000507547 828 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC010442.2-201ENST00000509301 407 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC108082.1-201ENST00000510857 331 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 OVOL1-AS1-203ENST00000534178 493 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 LINC02354-202ENST00000548564 573 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 SKAP1-AS1-201ENST00000582246 687 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC005336.1-201ENST00000585431 1243 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC015936.1-201ENST00000591013 1028 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC018695.2-201ENST00000602789 498 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC010335.3-201ENST00000623767 531 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 C20orf96-203ENST00000400269 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 KCNAB1-203ENST00000389636 1806 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 ACAD11-204ENST00000481970 1891 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 RGPD4-AS1-202ENST00000457647 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 DDC-206ENST00000431062 1620 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 KRT40-201ENST00000377755 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 NR0B1-201ENST00000378963 475 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 IQCF6-201ENST00000398780 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 ANO7-203ENST00000402530 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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