Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AP1G1-218ENST00000569748 4554 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PRLR-211ENST00000511486 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PAX9-202ENST00000402703 3104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 SERINC4-201ENST00000299969 2318 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 RPGRIP1-213ENST00000557771 3870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PLEKHA2-209ENST00000617275 5582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ZNF827-201ENST00000379448 4197 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PPP6C-202ENST00000415905 4172 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 CASP7-204ENST00000369321 2620 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ADGRE5-202ENST00000357355 3054 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ZNF215-207ENST00000610573 1503 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 WDR25-206ENST00000554998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PMEL-201ENST00000449260 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 STRADA-202ENST00000336174 2255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 RFC3-201ENST00000380071 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 YY2-201ENST00000429584 2741 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 GBE1-201ENST00000429644 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 SEPT9-205ENST00000427674 3937 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 MPP2-202ENST00000377184 4206 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 MPP7-202ENST00000375719 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ASB9-209ENST00000546332 1947 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 UBE2A-210ENST00000630695 1771 ntTSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC007608.4-201ENST00000623140 3365 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 CARD14-209ENST00000573882 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ALDH7A1-224ENST00000636743 2332 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 MBP-211ENST00000397875 2168 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ALDH18A1-201ENST00000371221 3337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 WASHC5-201ENST00000318410 4187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PNPLA6-220ENST00000600737 4195 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 CASP7-210ENST00000614447 2555 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 FYN-203ENST00000368667 2416 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ACR-201ENST00000216139 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 TMEM107-205ENST00000449985 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 TBC1D31-201ENST00000287380 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 MAP3K3-208ENST00000579585 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 CAMTA2-202ENST00000361571 4777 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 RGS3-207ENST00000374140 4591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 SLC7A7-202ENST00000397528 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 SLC7A7-203ENST00000397529 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PIFO-202ENST00000369738 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 DDX11L2-201ENST00000437401 1398 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AP001993.1-201ENST00000527317 2337 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 NRG1-212ENST00000521670 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 TAF1C-201ENST00000341690 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 OSBP2-204ENST00000407373 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 YY1AP1-202ENST00000311573 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AARS-201ENST00000261772 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC068299.1-201ENST00000624716 1749 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AL031846.2-201ENST00000624656 3671 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 BCAS3-202ENST00000407086 3496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 HMGCS1-202ENST00000433297 3466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 TMEFF2-202ENST00000392314 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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