Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 LIN28B-203ENST00000637759 2635 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 OACYLP-201ENST00000417918 2208 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 TRERF1-202ENST00000354325 4138 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 HMGB1-206ENST00000405805 4199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 CAPN13-201ENST00000295055 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 TAF5L-204ENST00000366676 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 ZNF189-203ENST00000374861 3134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 ATG5-208ENST00000635758 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 PLK4-203ENST00000507249 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 KIF22-202ENST00000400751 2493 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 GBE1-201ENST00000429644 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 GALT-201ENST00000378842 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 TIAM1-206ENST00000541036 7018 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AC068896.1-201ENST00000494792 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 SPATS2L-205ENST00000409151 1979 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 MON2-212ENST00000552115 3760 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 GNG11-201ENST00000248564 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 RPS10P7-201ENST00000441932 2329 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 LAMA4-207ENST00000424408 5983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 MCCC2-201ENST00000340941 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 FBF1-212ENST00000636174 3626 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 MED29-201ENST00000315588 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 LINC01973-201ENST00000374983 4678 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 CANX-209ENST00000504734 2232 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 CDH1-212ENST00000611625 4878 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 HHIPL2-201ENST00000343410 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 PLEKHG6-204ENST00000449001 3111 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms