Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MOG-225ENST00000431798 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ENTPD3-203ENST00000445129 1658 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CCT8-211ENST00000540844 1927 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PRADC1P1-201ENST00000412317 525 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ZNF589-202ENST00000412564 593 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CITED1-206ENST00000431381 941 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CITED1-207ENST00000445983 820 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 P2RX6P-202ENST00000450626 357 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PRKRIP1-202ENST00000462601 884 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC006262.2-202ENST00000600152 333 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC073254.1-209ENST00000604677 631 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC104440.1-201ENST00000605010 343 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ZFP69B-201ENST00000361584 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MDM1-204ENST00000411698 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CLUHP8-201ENST00000547527 1485 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 THEGL-202ENST00000512175 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MED27-201ENST00000292035 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 LILRB4-205ENST00000430952 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms