Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 RPUSD4-208ENST00000533628 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 PABPC1P2-201ENST00000471997 1805 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 LSM8-201ENST00000249299 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 TPD52L3-203ENST00000381428 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC025538.1-201ENST00000510707 1486 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 CRYBB2-201ENST00000398215 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC012066.1-201ENST00000439252 694 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SLC10A7-208ENST00000511374 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC073610.2-201ENST00000537495 406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AP000753.1-201ENST00000542805 573 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 OSGIN1-206ENST00000565123 833 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 CIRBP-AS1-201ENST00000585832 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 PDZRN3-AS1-203ENST00000608743 780 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC010182.1-201ENST00000548943 2434 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 RORC-201ENST00000318247 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 LIPC-202ENST00000356113 2161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC034238.1-214ENST00000609699 1590 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 TUBB8-207ENST00000568866 1367 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC139491.6-202ENST00000637171 2077 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 PCTP-202ENST00000325214 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 LUC7L-203ENST00000397780 1335 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AL590428.1-201ENST00000428865 1973 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 MDM1-204ENST00000411698 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 HRASLS2-201ENST00000255695 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 NHP2-201ENST00000274606 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 UGT1A6-202ENST00000373424 1128 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 CD27-AS1-201ENST00000399492 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 FAM138A-201ENST00000417324 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 PHBP11-201ENST00000420550 809 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 HNRNPA1P9-201ENST00000450624 950 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC092944.1-204ENST00000475102 384 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 FAM138D-201ENST00000504074 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 FAM138E-201ENST00000507796 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 LINC01606-208ENST00000521653 557 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 LINC02182-201ENST00000569362 498 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC104423.1-201ENST00000591742 728 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AL645940.1-201ENST00000606432 594 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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