Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 RN7SL2-201ENST00000490232 300 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 RN7SL4P-201ENST00000584058 295 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AC010319.2-201ENST00000594663 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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