Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 AC026304.1-201ENST00000597953 561 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMG20BQ9P0W2 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms