Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC116337.3-201ENST00000505200 846 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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