Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 RASGEF1A-203ENST00000395809 4104 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 E2F8-205ENST00000620009 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 USP20-203ENST00000372429 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 SH3RF2-206ENST00000511217 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 EPB41L2-204ENST00000392427 3369 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 GOLGA6L4-203ENST00000510439 4563 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 LOXL2-201ENST00000389131 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 RTEL1P1-201ENST00000504490 3685 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 MROH1-211ENST00000544576 3673 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ROR2-201ENST00000375708 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AL353611.2-201ENST00000625008 2897 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 DDR1-232ENST00000418800 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PARP6-223ENST00000616176 2102 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AIF1L-207ENST00000372309 3515 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ZIC4-217ENST00000525172 4152 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 TFIP11-202ENST00000407148 2789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 SHOC2-202ENST00000369452 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 TBC1D8-201ENST00000376840 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 UBXN4-201ENST00000272638 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 EIF3C-204ENST00000564243 2870 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ADAMTS20-202ENST00000395541 4633 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 HSPBAP1-201ENST00000306103 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 NAB1-201ENST00000337386 4358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 KLK10-203ENST00000391805 3006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 LILRA4-201ENST00000291759 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 SLC2A9-208ENST00000506583 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PLIN5-206ENST00000592610 1903 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 FCRL1-201ENST00000358292 2778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC020897.1-201ENST00000587702 561 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 TMPO-212ENST00000556029 4242 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 LILRA6-203ENST00000396365 1890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 USHBP1-201ENST00000252597 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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