Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 FMR1-218ENST00000621447 1832 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 MEMO1-207ENST00000426310 1336 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC099689.1-201ENST00000624383 1302 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC244197.2-201ENST00000370438 655 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 TRIM15-206ENST00000376688 426 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 RCC2P7-201ENST00000405832 1264 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AGAP13P-201ENST00000417888 363 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AL357558.2-201ENST00000431915 425 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 TGFA-207ENST00000450929 950 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 SPTY2D1-AS1-202ENST00000511927 573 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC006557.1-201ENST00000591211 1085 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 LINC00959-202ENST00000637128 826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 SERF1A-209ENST00000513436 1693 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATRXP46100 STYXL1-206ENST00000431581 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 EHMT1-210ENST00000478940 591 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 MYCT1-202ENST00000529453 724 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AP002383.2-201ENST00000545768 675 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ZBTB25-203ENST00000555424 565 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 RAB11A-203ENST00000564910 978 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 MIR4539-201ENST00000579784 60 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC124254.1-201ENST00000583629 562 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC008738.4-201ENST00000590492 700 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AL109983.1-201ENST00000603234 646 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 LINC01988-202ENST00000636975 921 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 OR2A25-203ENST00000641663 1741 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 LILRA5-201ENST00000432233 1363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 IGF2BP1-202ENST00000431824 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 PRY-201ENST00000303728 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 PRY2-201ENST00000303804 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 OR2T33-201ENST00000318021 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 PRYP3-201ENST00000343584 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC006022.1-201ENST00000425261 388 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 RN7SL211P-201ENST00000485246 276 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 RPLP0P2-204ENST00000490750 961 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 PHBP8-201ENST00000493810 725 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 RN7SL833P-201ENST00000498758 284 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 PTDSS1-206ENST00000522072 1112 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC079360.1-201ENST00000543848 434 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC051619.6-201ENST00000558039 595 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 SNAPC5-205ENST00000563480 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 DSCR9-203ENST00000581640 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AP002414.5-201ENST00000591853 258 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 EIF3K-213ENST00000593149 760 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 RPL37A-212ENST00000600880 425 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 LIN28A-202ENST00000326279 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 HP-203ENST00000357763 1482 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 TEX101-203ENST00000602198 1446 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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