Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 CYFIP2-222ENST00000620254 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 STPG4-201ENST00000294947 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 HEY2-202ENST00000368365 2461 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 SH2D2A-203ENST00000392306 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 DRD3-204ENST00000467632 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 DMKN-244ENST00000480502 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 ZCWPW1-208ENST00000490721 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 ZFP37-203ENST00000555206 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 GMPR2-224ENST00000559910 1562 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 LINC01649-202ENST00000634255 1743 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 HTR4-201ENST00000360693 3082 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPOP42166 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMPOP42166 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMPOP42166 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMPOP42166 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMPOP42166 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMPOP42166 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMPOP42166 FMR1-218ENST00000621447 1832 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMPOP42166 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMPOP42166 FOSB-203ENST00000443841 3346 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMPOP42166 IL18BP-202ENST00000337131 1606 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMPOP42166 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMPOP42166 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMPOP42166 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMPOP42166 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMPOP42166 CLUHP8-201ENST00000547527 1485 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TMPOP42166 PITPNB-201ENST00000320996 2826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPOP42166 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPOP42166 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPOP42166 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPOP42166 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPOP42166 DMKN-203ENST00000402589 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPOP42166 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPOP42166 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPOP42166 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPOP42166 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPOP42166 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPOP42166 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPOP42166 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPOP42166 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPOP42166 TACC1-208ENST00000520340 1976 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPOP42166 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPOP42166 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPOP42166 C1QTNF3-202ENST00000382065 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPOP42166 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPOP42166 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 HACD3-207ENST00000566074 1658 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 PEX5-201ENST00000266563 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 MRPL27-201ENST00000225969 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms