Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USH1CQ9Y6N9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms