Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00312Q9Y6C7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms