Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD54BQ9Y620 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms