Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X4

NR2E3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E3Q9Y5X4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NR2E3Q9Y5X4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms