Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5S2

CDC42BPB, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42BPBQ9Y5S2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CDC42BPBQ9Y5S2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDC42BPBQ9Y5S2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms