Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NRXN3Q9Y4C0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
NRXN3Q9Y4C0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NRXN3Q9Y4C0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NRXN3Q9Y4C0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NRXN3Q9Y4C0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NRXN3Q9Y4C0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NRXN3Q9Y4C0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NRXN3Q9Y4C0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN3Q9Y4C0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN3Q9Y4C0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN3Q9Y4C0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN3Q9Y4C0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN3Q9Y4C0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN3Q9Y4C0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN3Q9Y4C0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN3Q9Y4C0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN3Q9Y4C0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NRXN3Q9Y4C0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
NRXN3Q9Y4C0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NRXN3Q9Y4C0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NRXN3Q9Y4C0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NRXN3Q9Y4C0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NRXN3Q9Y4C0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NRXN3Q9Y4C0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NRXN3Q9Y4C0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NRXN3Q9Y4C0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NRXN3Q9Y4C0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NRXN3Q9Y4C0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NRXN3Q9Y4C0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NRXN3Q9Y4C0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NRXN3Q9Y4C0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NRXN3Q9Y4C0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NRXN3Q9Y4C0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NRXN3Q9Y4C0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NRXN3Q9Y4C0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NRXN3Q9Y4C0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NRXN3Q9Y4C0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NRXN3Q9Y4C0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NRXN3Q9Y4C0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms