Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P8

SIT1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIT1Q9Y3P8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIT1Q9Y3P8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIT1Q9Y3P8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIT1Q9Y3P8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIT1Q9Y3P8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIT1Q9Y3P8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIT1Q9Y3P8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIT1Q9Y3P8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIT1Q9Y3P8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIT1Q9Y3P8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SIT1Q9Y3P8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIT1Q9Y3P8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms