Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K5

R3HDM2, R3H domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM2Q9Y2K5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM2Q9Y2K5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM2Q9Y2K5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM2Q9Y2K5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM2Q9Y2K5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM2Q9Y2K5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM2Q9Y2K5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM2Q9Y2K5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM2Q9Y2K5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM2Q9Y2K5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HDM2Q9Y2K5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
R3HDM2Q9Y2K5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HDM2Q9Y2K5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HDM2Q9Y2K5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HDM2Q9Y2K5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HDM2Q9Y2K5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HDM2Q9Y2K5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HDM2Q9Y2K5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HDM2Q9Y2K5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HDM2Q9Y2K5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HDM2Q9Y2K5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HDM2Q9Y2K5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HDM2Q9Y2K5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HDM2Q9Y2K5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HDM2Q9Y2K5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HDM2Q9Y2K5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HDM2Q9Y2K5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HDM2Q9Y2K5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HDM2Q9Y2K5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HDM2Q9Y2K5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HDM2Q9Y2K5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HDM2Q9Y2K5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HDM2Q9Y2K5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms