Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G3

ATP11B, Probable phospholipid-transporting ATPase IF, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11BQ9Y2G3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP11BQ9Y2G3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP11BQ9Y2G3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP11BQ9Y2G3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP11BQ9Y2G3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP11BQ9Y2G3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP11BQ9Y2G3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP11BQ9Y2G3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP11BQ9Y2G3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP11BQ9Y2G3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP11BQ9Y2G3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP11BQ9Y2G3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP11BQ9Y2G3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP11BQ9Y2G3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP11BQ9Y2G3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP11BQ9Y2G3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP11BQ9Y2G3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP11BQ9Y2G3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP11BQ9Y2G3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP11BQ9Y2G3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP11BQ9Y2G3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP11BQ9Y2G3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP11BQ9Y2G3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP11BQ9Y2G3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms