Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFR3BQ9Y2G0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms