Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BTRCQ9Y297 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
BTRCQ9Y297 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
BTRCQ9Y297 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BTRCQ9Y297 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BTRCQ9Y297 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BTRCQ9Y297 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BTRCQ9Y297 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BTRCQ9Y297 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BTRCQ9Y297 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BTRCQ9Y297 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms