Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPS5Q9UPZ3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms