Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT6

MAPK8IP3, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPK8IP3Q9UPT6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
MAPK8IP3Q9UPT6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAPK8IP3Q9UPT6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms