Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC12A4Q9UP95 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms