Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP18Q9UMW8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
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