Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms