Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMKLBQ9ULI2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMKLBQ9ULI2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms