Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB23Q9ULC3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB23Q9ULC3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.9 ms