Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms