Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA2Q9UL42 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms