Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SARDHQ9UL12 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARDHQ9UL12 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms