Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HDAC9Q9UKV0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDAC9Q9UKV0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC9Q9UKV0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms