Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MSRAQ9UJ68 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MSRAQ9UJ68 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MSRAQ9UJ68 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MSRAQ9UJ68 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSRAQ9UJ68 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSRAQ9UJ68 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSRAQ9UJ68 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSRAQ9UJ68 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSRAQ9UJ68 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MSRAQ9UJ68 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSRAQ9UJ68 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSRAQ9UJ68 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSRAQ9UJ68 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSRAQ9UJ68 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSRAQ9UJ68 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSRAQ9UJ68 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSRAQ9UJ68 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSRAQ9UJ68 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSRAQ9UJ68 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSRAQ9UJ68 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSRAQ9UJ68 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSRAQ9UJ68 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSRAQ9UJ68 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MSRAQ9UJ68 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms