Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPA4Q9UI42 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPA4Q9UI42 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms