Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF1Q9UH73 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms