Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD71

PPP1R1B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1BQ9UD71 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP1R1BQ9UD71 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R1BQ9UD71 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms