Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APEX2Q9UBZ4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms